蛋白质修饰研究新进展:SIRT5调节胞质和线粒体蛋白丙二酰化修饰
最近,权威的生命科学期刊Molecular Cell上发表一篇题为”SIRT5 Regulates both Cytosolic and Mitochondrial ProteinMalonylation with Glycolysis as a Major Target”的文章, 揭示了SIRT5是赖氨酸丙二酰化的全局性调控因子,并通过糖酵解途径来调节能量循环。
ClassIII去乙酰化酶家族(SIRT1~SIRT7)蛋白可以调节生物体内很多新陈代谢的过程,如SIRT3 作为定位于线粒体中的主要去乙酰化酶,通过调节赖氨酸乙酰化修饰来影响线粒体中代谢酶的活性。与SIRT3不同,SIRT5 能同时定位于线粒体和胞质之中。尽管被定义为去乙酰化酶家族中的一员,SIRT5确被证明与乙酰化调节相关甚少,而是作为一个新型的去酰基化修饰酶,与赖氨酸去琥珀酰化(succinylation)与去丙二酰化(malonylation)密切相关(Cell Metabolism, 2013; Molecular CellProteomics, 2011)。然而,对SIRT5调节去丙二酰化在生物体内的功能仍知之甚少。
在该项研究中,采用SIRT5敲除的小鼠模型,研究人员使用非标 (Label free) 定量蛋白质修饰组分析,在430个蛋白中鉴定到1137个丙二酰化位点,其中120个蛋白中的183个赖氨酸丙二酰化位点在SIRT5敲除的小鼠肝脏中发生了显著的丙二酰化修改改变,其中16%的赖氨酸丙二酰化位点和28%的丙二酰化蛋白质都是由SIRT5调节的。而且,在SIRT5敲除的小鼠中,科研人员观察到糖酵解途径受到了明显抑制,通过进一步的通路分析(pathway analysis) 可以发现,糖酵解途径是由SIRT5来调控的。研究人员还发现SIRT5调节的肝脏组织线粒体中丙二酰化和琥珀酰化位点存在着重叠。56%的丙二酰化位点和琥珀酰化位点是重合的,剩余44%的丙二酰化位点是不同于琥珀酰化和乙酰化位点的。此外,SIRT5还被证明能够抑制糖酵解途径的负反馈作用,这一负反馈作用是由malonyl-CoA来调节的,而malonyl-CoA又是赖氨酸丙二酰化修饰的丙二酰基供体。不久前发表的”Lysine malonylation iselevated in type 2 diabetic mouse models and enriched in metabolic associatedproteins”中也曾提到,2型糖尿病及前驱糖尿病中malonyl-CoA水平有显著上调,其生物功能可能间接影响赖氨酸丙二酰化修饰的生物学意义。
赖氨酸丙二酰化修饰在2011年由美国芝加哥大学的研究人员首次发现 (Molecular Cell Proteomics, 2011),之后便受到了科学家们的广泛关注。景杰生物(PTM Biolabs)开发出了赖氨酸丙二酰化修饰泛抗体,这种新型蛋白质修饰泛抗体的成功开发在世界上是独一无二的。依托于公司自主研发的高质量蛋白质修饰类抗体和富集材料,景杰生物推出了定量蛋白质丙二酰化修饰组分析,有力的推动了丙二酰化修饰领域研究的发展。除此之外,景杰生物还能够为科研人员提供多达12种修饰的高质量蛋白质修饰泛抗体 (pan antibody) 和蛋白质泛抗体偶联树脂(antibody conjugated agarose beads),这其中包括赖氨酸乙酰化 (acetylation)、甲基化 (methylation)、泛素化 (ubiquitination)、酪氨酸磷酸化 (phosphorylation)、O-乙酰氨基葡萄糖化 (O-GluNAc)、赖氨酸琥珀酰化 (succinylation)、巴豆酰化 (crotonylation)、丙酰化(propionylation) 等修饰泛抗体,同样还有对应的修饰底物高通量鉴定和修饰动态定量研究服务,为多角度的蛋白质翻译后修饰研究提供了技术保证。
本文由景杰生物翻译编辑,欢迎转载